La construction de la chapelle Caetani a été achevée en 1296 à la demande du pape Boniface VIII, afin d'abriter les restes de certains parents du pontife et de célébrer son double pouvoir, temporel et spirituel, ainsi que sa lignée familiale.
Sur le mur est, on peut admirer la sépulture de Caetani, constituée d'un ciboire à deux colonnes adossé au mur. Il y a deux sarcophages funéraires, le plus petit présente une décoration en mosaïque avec cinq boucliers héraldiques de la famille Caetani. Selon la tradition, la famille Caetani serait originaire de la ville maritime de Gaeta, d'où proviennent les deux vagues marines sur fond d'or qui caractérisent ses armoiries et le nom "Gaetani", ou dans la version romaine plus courtoise, "Caetani".
La fresque qui décore la partie du mur encadrée par le ciboire a été peinte entre la fin de 1296 et 1299, mais elle a subi de nombreuses modifications au cours des siècles suivants. Au centre, la Vierge est assise sur un trône avec l'Enfant béni ; sur les côtés, saint Étienne à droite, et peut-être l'archevêque de Canterbury Thomas Becket à gauche, sont en train de présenter deux personnages agenouillés. Il s'agit de deux membres importants de la famille Caetani : celui de droite est Roffredo II, le très puissant comte de Caserte, frère de Boniface VIII ; celui de gauche, qui avait à l'origine un chapeau de cardinal près de ses genoux, était le cardinal Benedetto II Caetani. En raison de rénovations malheureuses, effectuées avant 1749 et à nouveau au cours du XIXe siècle, le chapeau du cardinal a disparu de la fresque et le cardinal a été transformé en un frère franciscain, identifié comme le bienheureux Andrea Conti, oncle maternel du pape Boniface VIII.
Nous pouvons maintenant quitter le niveau de l'église pour descendre dans le sous-sol de la Cathédrale grâce à l'escalier situé juste devant la chapelle Caetani. Nous vous rappelons que dans les trois salles souterraines l'utilisation du flash est absolument interdite et que vous ne pouvez entrer dans les salles 9 et 10 seulement lorsque les lumières sont allumées. Nous vous rappelons également que lorsque les lumières de la crypte s’éteignent, vous devez continuer à avancer et sortir de la crypte par l'escalier opposé. C'est pourquoi nous vous conseillons d’attendre que les lumières s’allument pour disposer du temps nécessaire à la visite, soit l’ensemble des vingt minutes. Nous vous recommandons également de ne pas vous appuyer contre les murs, les colonnes ou le système d'éclairage.